原生Android和定制安卓的一些明显的区别。
系统自动管理后台 vs 用户管理应用自启和唤醒
国产定制安卓基本允许在免Root状态下，就能控制应用自启、权限和相互唤醒等原本是取得Root权限之后才能实现的功能，甚至这一功能还在三星等部分国际大厂的系统中实现；而原生Android系统则无法对这些直接进行设置，只能Root后通过第三方应用进行管理，且目前并不是太稳定。
众所周知，由于国内的安卓应用滥用唤醒权限和通知栏推送，因而经常会导致多条推送一起骚扰用户，让用户防不胜防，而这一功能实际上是不少国内用户所需要的。
统一界面字体 vs 丰富的主题字体引擎
原生Android的界面和字体都是完全统一的，系统内没有自带的主题引擎。注意，原生安卓不等于CM等支持主题引擎的第三方ROM。而定制安卓为了张扬用户的个性，基本都会内置专用的主题或字体引擎方便用户更换。
原生安卓彩蛋 vs 没有彩蛋
原生安卓多次点击版本号就会跳出安卓彩蛋，例如安卓7.0的就是N字母，之后还可以玩抓猫游戏。而部分国产定制的安卓系统就把这个菜单给砍掉了，不过也有一些保留了彩蛋的国产厂商，例如华为、一加等。
内置谷歌全家桶 vs 残血阉割版系统
原生系统的一大特点就是内置了丰富的谷歌全家桶，不仅包括谷歌服务、Play商店、环聊等常用应用，甚至还有谷歌Play音乐、电影、图书、游戏等各种嫡系app。而因为众所周知且不可描述的原因，安卓系统到了国内这些全家桶基本要剔除。
系统臃肿 vs 极度精简
由于加入了各种各样的定制功能，定制安卓的系统往往显得比较臃肿，即使另外不运行app，运存占用也是非常大的。而原生Android主打的则是极度精简，占用运存较小，即使是小运存手机，在管理好权限的基础上也不至于卡死。
各种一键式设置 vs 最基本设置
国产定制安卓在交互理念上有些像iOS，就是把所有的功能都给用户准备好了，这样用户只需要自己开关某些功能，即可充分实现自定义。
而原生Android则不同，其设置菜单仅有一些最基本的选项，以满足用户使用。如果你动手能力较强的话，原生Android反而能提供更大的发挥空间让你充分的DIY。
谷歌Play商店 vs 各厂商应用商店
原生安卓内置的应用商店是安卓系统的官方商店，前身叫安卓市场（Android Market），现在叫作谷歌Play商店。其拥有最正规、权限最干净且更新速度最快的一手国内外安卓app资源，但同样因为不可描述原因无法直接访问。
因此，国内各大厂商也在定制安卓中加入了自己的应用商店，很多都是挂靠在应用宝等第三方市场下，实现资源互通。国内应用市场的生态就比较乱，权限比较杂，各种广告弹窗，另外安全性也是个问题。